以功能性消化不良、消化性溃疡、肝硬化、消化道肿瘤等疾病的诊疗以及消化内镜下治疗为特色，设有南通地区首个“慢性腹泻、便秘”专病联合门诊。消化内镜中心每周一至周五常规开展内镜下诊断及经消化内镜下的各种微创治疗，每周三、五开展无痛胃镜检查及无痛内镜下治疗，可进行内镜下直接寻找病变、活检、HP检测、各种急性止血、息肉摘除、晚期癌症的支架置放治疗、取异物等诊疗项目。